Mặc dù còn nhiều thiếu thốn về cơ sở vật chất (CSVC), cùng một lúc nhà trường phải tổ chức dạy và học ở 2 địa điểm nhưng với tinh thần vượt khó, khắc phục khó khăn; Trường THPT Thanh Thủy đã phát huy nội lực, tiếp tục xác định đổi mới quản lý là bước đột phá và đổi mới phương pháp dạy học là then chốt. Đội ngũ cán bộ, giáo viên trẻ, tâm huyết với nghề, nhiệt tình, trách nhiệm với công việc.Năm học 2012 – 2013 Trường THPT Thanh Thủy vẫn tiếp tục giữ vững chất lượng giáo dục cả về đại trà và chất lượng mũi nhọn. Đó là đánh giá của lãnh đạo huyện Thanh Thủy, tỉnh Phú Thọ tại lễ Tổng kết năm học 2012 – 2013 giành cho thầy và trò Trường THPT Thanh Thủy.